Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms