Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGAP28Q9P2N2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms