Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms