Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms