Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GOPCQ9HD26 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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