Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms