Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100803.1-201ENST00000501440 1380 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121972.2-202ENST00000429386 586 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002852.2-201ENST00000519630 740 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007342.1-201ENST00000565073 706 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms