Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms