Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms