Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms