Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms