Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms