Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NBEAQ8NFP9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NBEAQ8NFP9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NBEAQ8NFP9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NBEAQ8NFP9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NBEAQ8NFP9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NBEAQ8NFP9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NBEAQ8NFP9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NBEAQ8NFP9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NBEAQ8NFP9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NBEAQ8NFP9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NBEAQ8NFP9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NBEAQ8NFP9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NBEAQ8NFP9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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