Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms