Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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C9orf40Q8IXQ3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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C9orf40Q8IXQ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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C9orf40Q8IXQ3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf40Q8IXQ3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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