Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms