Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms