Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms