Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms