Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms