Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms