Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms