Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA8Q53HL2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms