Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms