Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SP6Q3SY56 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SP6Q3SY56 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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SP6Q3SY56 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SP6Q3SY56 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SP6Q3SY56 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SP6Q3SY56 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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