Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC27Q2M243 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms