Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RTL8BQ17RB0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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RTL8BQ17RB0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RTL8BQ17RB0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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