Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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