Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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