Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PTPRRQ15256 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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PTPRRQ15256 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PTPRRQ15256 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PTPRRQ15256 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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