Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms