Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms