Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CKAP5Q14008 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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