Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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