Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHROOM2Q13796 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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SHROOM2Q13796 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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SHROOM2Q13796 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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