Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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