Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
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