Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TROQ12816 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TROQ12816 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TROQ12816 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TROQ12816 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TROQ12816 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TROQ12816 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TROQ12816 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TROQ12816 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TROQ12816 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TROQ12816 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms