Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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