Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms