Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms