Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FPGSQ05932 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FPGSQ05932 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms