Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms