Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms