Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms