Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms