Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPM4P67936 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPM4P67936 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPM4P67936 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM4P67936 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM4P67936 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM4P67936 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM4P67936 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM4P67936 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM4P67936 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM4P67936 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM4P67936 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms