Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms