Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms