Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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